5-HT约2/3在肝脏与硫酸或葡萄糖醛酸结合后排出，或将吲哚断裂而分解;约1/3风景单氨氧化酶作用氧化脱氨形成5-HIAA后从尿排出。5-HIAA是5-羟色氨酸代谢的最终产物，不具有生物活性。
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正常值
定性：(新鲜尿)阴性。定量(尿)：10.5～42.0μmol/24h(2～8mg/24h)
临床意义阳性(或升高)：类癌瘤综合征、食品和药物(香蕉、西红柿、杏、核桃、茄子、利血平、酚噻嗪衍生物、卢戈氏液)。
