微小病变性肾病的发病机制不明，其特征为肾小球毛细血管壁阴电荷的丢失。本病也可发生于移植肾，因此，支持了循环血中可能存在耗损肾小球阴电荷的体液因子的看法。后者损害了肾小球的电荷屏障，产生选择性蛋白尿。

　　另外，在何杰金病并发的微小病变性肾病，对类固醇和烷化剂有效，切除受累淋巴结后肾病可迅速缓解，某些病人并发病毒感染如麻疹后，疾病也缓解，这些都提示Ｔ淋巴细胞功能异常，由其产生的某些淋巴因子，使肾小球毛细血管壁通透性增加。但该种物质至今尚未能得到明确证实。