由于肘关节结核常表现为疼痛、局部肿胀、压痛、活动功能受限等，这些症状并非其特有表现，临床上还有许多疾病的临床表现与之相似，故需对这些疾病进行鉴别诊断，其中包括有以下几种疾病：

　　1、化脓性骨髓炎 病人有全身感染中毒反应病史，病变局部有化脓性炎症反应例如红、肿、热、痛，起病急骤，局部穿刺液细菌培养常为化脓性细菌。

　　2类风湿性关节炎 该病为多发性、对称性关节发病，类风湿因子常为阳性。当鉴别有困难时，可行滑膜活检。

　　3、化脓性脊椎炎;

　　4、肿瘤;

　　5、其它还包括骨质疏松症， 神经性关节病等也须鉴别。