生理性绝经是卵巢功能自然衰退的结果意味着卵巢生殖功能终止。妇女卵巢普遍在生命历程的中期阶段开始衰老生殖力终止明显早于人类特有的一个明显生物学特征
1.绝经的年龄 绝经年龄反映卵巢的生殖寿命细胞衰老是绝经的结果影响绝经年龄的因素有遗传营养、胖瘦居住地区的海拔高度嗜烟等。
2.遗传因素对绝经妇女的影响 人体的DNA序列及其变异，反映了人类的进化过程研究不同人群和不同个体的DNA序列变异(即多态性，polymorphisms)有助于了解人类的生理变化疾病的发生发展，以及对药物治疗的反应。
携带人体遗传信息的DNA由四个不同的碱基组合而成。人类基因组约有33亿个碱基对目前已基本测出了它们的排列顺序不同人基因组中碱基的排列顺序绝大多数一致，但也存在极小差异主要体现在DNA个别位置上碱基排列有所不同这种遗传性变异被称作单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphismSNP)。人类基因组中约有1000万种SNP。不同人之所以对同种疾病的易感程度有所不同，对相同药物有时也会产生不同的反应与SNP的差异有关同样SNP也在不同程度上影响了绝经妇女的各种生理状况和疾病发生的差异。
许多基因的多态性与绝经时间和绝经后某些疾病的发病有关
绝经期极早提前(premature)者，常常伴随雌激素水平降低因此对绝经后的健康产生重要影响。绝经时间较早，是心血管疾病骨质疏松症和卵巢肿瘤的高度危险因素，并使死亡率增加。因此从临床的观点来看确定影响绝经年龄的因素非常重要。
越来越多的研究发现某些基因的多态性与绝经及绝经后疾病的发生有关。
(1)雌激素受体(ER)基因多态性：①雌激素受体(ER)的结构与功能②ER基因的多态性。③ER基因多态性与绝经的关系④ER基因多态性与绝经后骨密度的关系⑤ER基因多态性与绝经后激素替代疗法(HRT)
绝经后接受HRT治疗的女性由于她们的ER基因多态性影响了高密度脂蛋白(HDL)的水平，因此对HRT的量效产生影响。
综上所述，雌激素受体基因多态性从不同层次影响到绝经时间和骨代谢，并对HRT治疗发挥作用。若临床工作者通过检测ER基因型来预测绝经后骨质疏松的危险性以及对HRT治疗的反应将对骨质疏松的早期防治和HRT个性治疗方案的制定发挥重要的作用。
(2)维生素D受体基因多态性：①维生素D受体的结构与功能②VDR基因的多态性。③VDR多态性与绝经后骨密度和骨质疏松的关系
(3)其他基因多态性：
①降钙素受体(calcitonin receptor，CTR)基因多态性。②Ⅰ型胶原(COLIAI)基因多态性：COLIAI与骨量和骨质疏松性骨折有关。③白介素-6(IL-6)基因多态性。④转移生长因子β基因转移生长因子β(TGF-β)基因多态性。⑤CYP 17和CYP19基因
(4)基因多态性的检测：基因多态性的研究离不开对基因多态性位点的检测
①限制性片段长度多态性(RFLP)②短串联重复序列③扩增片段长度多态性。④单链构象多态性(SSCP)⑤基因芯片与SNP图谱。
3.卵巢的衰老
(1)卵泡的减少和卵巢形态老化：出生时卵巢约有70万～200万个卵泡青春期还有约40万个绝经时可能残留极少数卵泡。两个途径导致卵泡减少：排卵和闭锁从青春期至绝经，仅有400个卵泡能发育成熟并排卵，绝大多数卵泡自然闭锁，其机制目前尚不了解，是否归因于细胞凋亡尚待研究
(2)卵巢功能的衰退：
①生殖功能：妇女生育力在30～35岁即开始下降，接近40岁时明显下降。从规律月经到绝经，通常要经历一段不规则月经期此期卵泡成熟不规律，有排卵或无排卵，周期有正常长短或完全不能预料。因此，周期长度及其变化也可用于反映卵巢功能当无卵泡发育绝经生殖功能即终止。
②内分泌功能：在卵巢生殖功能衰退的同时，内分泌功能也衰退表现为卵泡发育中合成分泌的性激素主要是雌孕激素的变化首先是孕激素的下降，40岁左右，卵泡发育的程度不足可能表现为孕酮(P)的相对不足卵泡发育不充分的程度增强可以导致无排卵，发生孕酮绝对不足。随后随着卵泡数的减少，发育不足产生和分泌的雌激素，主要是E2(雌二醇)的总量逐渐减少;在绝经过渡期，由于无排卵导致孕酮不足时卵泡发育生成的E2可能不缺乏，若卵泡发育的数目多，程度高，或持续，E2甚至相对过多绝经后卵泡不发育，基本不产生E2。在增高的Gn作用下间质分泌睾酮(T)增多卵巢分泌的另一类激素-肽类激素如抑制素(inhibin)逐渐降低，其下降先于E2 。
4.生殖道的萎缩性改变 外阴失去大部分胶原、脂肪和保留水分的能力腺体萎缩分泌减少皮脂分泌也减少，皮肤变薄、干易裂阴道缩短、变窄皱褶减少壁变薄弹性减弱分泌减少。早期呈现充血性改变，壁脆易受伤和出血有弥漫性或散在瘀斑，晚期颜色苍白、粘连带增多。
