本病需与以下疾病进行鉴别：
1.类风湿性关节炎 腕关节是风湿性关节炎的好发部位。可显示骨质疏松，关节边缘小囊状缺损，关节间隙变窄，病理性半脱位，或骨性强直，但它常对称性地累及多关节，其症状间断发作，骨表面糜烂或呈小囊状吸收，不会有脓肿、窦道或死骨形成。患者常为40岁左右的妇女，多为双侧性，常与其他关节病变同时存在。单发的不易与滑膜结核鉴别。确诊须靠活检和细菌学检查。
2.月骨坏死 多见于青壮年男性，患者常为体力劳动者。主诉腕关节慢性肿痛，多有外伤史。X线片初期可见月骨相对致密，晚期月骨变扁，边缘不整齐。患者血沉不快，其他腕骨正常。
3.Brodie骨脓肿 桡骨下端偶可见到Brodie骨脓肿。X线片可见到桡骨下端有局限性溶骨性破坏，一般无死骨，骨壁稍硬化。常不易与中心型骨结核相鉴别。须靠手术探查，细菌培养和病理检查。
4.腱鞘结核 受累腱鞘呈葫芦形肿胀，手指功能受限。鉴别要点是X线片阴性，肿胀与压痛只限手腕或手掌的一侧。
5.腕部肿瘤 桡骨下端是原发骨肿瘤的好发部位，巨细胞瘤、网织细胞肉瘤都能见到，肿瘤较小时需与中心型结核的骨空洞相鉴别，前者系溶骨性破坏，后者空洞壁有反应性致密。
6.Sudeck 氏骨萎缩：与腕关节结核早期X线表现相似。前者主要累及骨松质，呈多数斑点状骨吸收现象，其皮质则光整锐利，不受破坏，关节间隙无改变。
